黃腐酸是具有膠體性的有機物質，它能使土壤疏松，吸附水量大，透氣增濕、養墑，防旱，使土壤有良好的水、氣、熱條件，適宜于種子萌發和苗期生長。

黃腐酸噴施到植物葉片，能夠使植物的氣孔關閉，減少植物水分蒸騰。黃腐酸顏色深，有利于吸收太陽能；黃腐酸受到微生物的作用分解時會放出熱量，能使地溫提高，從而起到抗寒的作用。黃腐酸參與土壤中離子交換反應，把土壤中的重金屬離子吸附固定，防止它們進入生物循環。黃腐酸官能團比較多，既可以和酸結合，又可以和堿結合，能夠根據作物需要調節土壤的酸堿度。

黃腐酸肥料是一種能增加植物體內酶的活性，增加植物機體的抵抗力。